Tunnistusmerkintä on koiran yksilöllinen tunniste, joka tehdään Suomessa joko mikrosirulla tai tatuoinnilla. Tunnistusmerkinnän avulla voidaan todeta, mikä koira on kyseessä.
Tunnistusmerkintä helpottaa löydetyn koiran tunnistamista ja edesauttaa omistajan löytämistä. Tämän takia on ensiarvoisen tärkeää, että koiran omistaja ilmoittaa itsensä koiran omistajaksi Kennelliiton rekisteriin.
Lisäksi koirien tunnistusmerkitseminen varmistaa terveystutkimuslausuntojen antamisen ja tallentamisen oikealle koiralle. Tunnistusmerkinnän avulla voidaan myös todeta, että näyttelyissä tai kilpailuissa esitettävä koira on rekisteritodistuksen mukainen.
Kasvattaja huolehtii pentujen tunnistusmerkinnästä jo ennen pentueen luovutusta ja rekisteröintiä. Myös pentueen vanhempien tulee olla tunnistusmerkittyjä.
Ylittäessään eri maiden rajoja on koirien oltava tunnistusmerkittyjä mikrosirulla. Koiran tulee olla tunnistusmerkitty alkuperämaassaan ja kun tuontikoira rekisteröidään Suomen Kennelliittoon, tallennetaan myös sen tunnistusmerkintätiedot. Kennelliitolla on virallisten rekisterien lisäksi myös tunnistusmerkintä- ja omistajarekisteri sekarotuisille ja rekisteröimättömille koirille.
Koirien tunnistusmerkintöjä voivat suorittaa eläinlääkärit ja Kennelliiton pätevöimät tunnistusmerkitsijät.